木棉湾学校迁建于1994年，于2019年8月28日由小学升格为九年一贯制学校。

　　学校坐落于深圳市龙岗区布吉街道育苗路1号，占地面积约2.3万平方米，建筑面积1.7万平方米，1999年被评为区一级学校，2000年获市办学效益奖，2001年被评为市一级学校，2003年被评为省一级学校，自2015年起连续四年获龙岗区小学综合学业质量优秀奖，并在2019年被评为龙岗区首批智慧校园示范校。曾获深圳市办学效益奖，为深圳市园林式、花园式学校，荣获深圳市绿色学校、深圳市广播操标兵（阳光体育）学校、龙岗区文明学校、龙岗区中小学德育示范校称号。

　　学校现设校长室、副校长室两个、副书记室、办公室、教学处、总务处、德育处、安全办九个行政办公室。现有学校领导3人,其中校长1人（吴中天为校长、党支部书记）,副校长2人，中层干部11人。

　　学校确立了“让每一朵木棉花开”的办学理念，践行“和悦”校园文化之路，以追求“智慧木棉、至善木棉、和乐木棉”为办学目标，办学特色日趋凸显，办学业绩蒸蒸日上。

龙岗区的初中还有深圳市龙岗区弘文学校、深圳市龙岗区龙联学校、深圳市龙岗区德龙学校、深圳市龙岗区龙城高级中学（教育集团）龙城创新学校、深圳市高级中学龙岗学校、深圳市罗湖区香港中文大学(深圳)附属礼文学校、深圳市龙岗区龙城初级中学、深圳市龙岗区宝荷学校、深圳市龙岗区龙城高级中学（教育集团）东兴外国语学校、华东师范大学附属深圳龙华学校等等。

深圳市龙岗区布吉街道木棉湾学校附近的学校还有深圳市龙岗区龙岭初级中学、深圳市龙岗区布吉贤义外国语学校、深圳市龙岗区石芽岭学校、深圳市龙岗区龙岭学校、深圳市龙岗区木棉湾实验学校、深圳市龙岗区爱义学校、深圳市龙岗区智民实验学校、深圳市龙岗区布吉街道可园学校、深圳市龙岗区百合外国语学校、深圳市龙岗区坪地坪西学校等等。